La actividad investigativa del programa de Licenciatura en Ciencias Naturales se encuentra enmarcada en los grupos de investigación adscritos a la Facultad de Ciencias de la Educación, y clasificados en el Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación, los cuales son interdisciplinarios, es decir, no se limitan a que los profesores correspondan dentro de un solo programa.